Cette découverte intervient quelques jours après celle des restes de sept personnes sur un site voisin, dans la région de Zubin Potok, où les autorités estiment que jusqu'à 23 victimes pourraient être enterrées.
"Lors des fouilles menées à Jabuka, les restes de quatre personnes ont été découverts puis exhumés. Selon les premières évaluations, ils appartiennent à des victimes de disparition forcée pendant la guerre", a indiqué dans un communiqué publié tard lundi la Commission gouvernementale des personnes disparues.
Les restes ont été envoyés dans un laboratoire pour des analyses ADN pour tenter d'identifier les victimes.
Les procureurs estiment que les travaux d'excavation et d'identification sur les deux charniers pourraient durer plusieurs mois.
Le parquet a également annoncé l'arrestation ces derniers jours de trois hommes de la région, soupçonnés de crimes de guerre.
Le Premier ministre Albin Kurti a déclaré samedi penser que les personnes enterrées à cet endroit avaient été "enlevées de force et exécutées" au printemps 1999.
La guerre du Kosovo (1998-1999), qui a opposé les forces serbes à la guérilla indépendantiste kosovare albanaise, a fait environ 13.000 morts et quelque 4.000 disparus.
Après des décennies de recherches, les restes de plusieurs milliers de victimes ont été retrouvés, mais environ 1.600 personnes sont toujours portées disparues.
